CEMS除了采用科学先进的在线监测技术之外，更重要的是从CEMS生产、安装、调试、验证、运行、维护以及监督考核等各个环节采取严格有效的质量保证和质量控制措施和要求，保障CEMS的数据质量，建立一套CEMS全过程质控规范体系。

固定污染源CEMS监测数据的全过程外部质控程序主要包括三个质量保证和质量控制阶段，即CEMS的生产和销售阶段；CEMS安装、调试和验收阶段；CEMS运行、维护和监督考核阶段。

1.CEMS的生产和销售阶段

CEMS生产企业应首先根据本企业CEMS产品的生产、组装、检验等质控文件开展CEMS产品的批量生产这阶段CEMS的外部质控措施是使用CEMS产品相关的环境监测仪器进行适用性检测。

目前国内的适用性检测工作由环境保护部环境监测仪器质量监督检验中心负责完成，检测方式为按产品型号抽查检测，检测过程包括实验室检测和污染源现场检测相结合，监测周期为三年。CEMS经适用性检测合格后方可在环境监测领域进行销售和使用。

2.CEMS安装、调试和验收阶段

CEMS产品销售后需要在现场进行安装、调试和验收工作，这个阶段包括安装调试后的“调试检测”和验收过程中的“验收检测”。

CEMS安装和调试主要包括：安装位置选择、配套环境设施的建设和CEMS安装自身规范性的内容。调试完成，至少7天后可进行调试检测，在调试检测合格后可向当地环保部门申请CEMS验收。验收合格后可正常出具监测数据，为环境管理和监管服务。

3.CEMS运行、维护和监督考核阶段

CEMS在污染源现场进行工作。由于现场噪声、振动、腐蚀等环境条件相对恶劣，且CEMS工作处于高温、高湿、高粉尘以及高腐蚀性的废气污染环境中，因此CEMS产品不仅需要长期稳定可靠运行的性能质量，更重要的是日常定期开展运营维护、校准校验、耗材更换以及故障维修等工作，以确保CEMS系统长期稳定的运行。